Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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