Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms