Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R3

Apom, Apolipoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApomQ9Z1R3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApomQ9Z1R3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms