Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snx1Q9WV80 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Snx1Q9WV80 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snx1Q9WV80 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snx1Q9WV80 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snx1Q9WV80 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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