Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ArcQ9WV31 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms