Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13bQ9WU72 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms