Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms