Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkab1Q9R078 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms