Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnnt3Q9QZ47 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms