Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms