Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Limd1Q9QXD8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Limd1Q9QXD8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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