Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms