Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chaf1aQ9QWF0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chaf1aQ9QWF0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms