Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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