Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ap3b2Q9JME5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap3b2Q9JME5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms