Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CubnQ9JLB4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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