Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scamp5Q9JKD3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms