Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms