Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms