Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms