Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms