Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl28Q9JIL2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms