Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn3Q9ES97 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms