Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms