Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tfcp2Q9ERA0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tfcp2Q9ERA0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms