Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SgshQ9EQ08 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms