Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnft1Q9DCN7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms