Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ftsj3Q9DBE9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms