Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf580Q9DB38 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms