Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp2aQ9DB34 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms