Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms