Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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