Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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