Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc94Q9D6J3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms