Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtm5Q9D6G9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtm5Q9D6G9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmtm5Q9D6G9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms