Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt34Q9D646 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms