Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc81Q9D5W4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms