Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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PrameQ9D4Z5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms