Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp2bpQ9D4C6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms