Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snrnp35Q9D384 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snrnp35Q9D384 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snrnp35Q9D384 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrnp35Q9D384 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrnp35Q9D384 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snrnp35Q9D384 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms