Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmem53Q9D0Z3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tmem53Q9D0Z3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tmem53Q9D0Z3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tmem53Q9D0Z3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tmem53Q9D0Z3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tmem53Q9D0Z3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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