Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfc5Q9D0F6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfc5Q9D0F6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfc5Q9D0F6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rfc5Q9D0F6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rfc5Q9D0F6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rfc5Q9D0F6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rfc5Q9D0F6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rfc5Q9D0F6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rfc5Q9D0F6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rfc5Q9D0F6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rfc5Q9D0F6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rfc5Q9D0F6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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