Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc47Q9D024 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms