Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Shisa9Q9CZN4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Shisa9Q9CZN4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Shisa9Q9CZN4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms