Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtpbp8Q9CY28 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms