Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl11Q9CXW4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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