Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Exo5Q9CXP9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Exo5Q9CXP9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Exo5Q9CXP9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Exo5Q9CXP9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Exo5Q9CXP9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Exo5Q9CXP9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Exo5Q9CXP9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Exo5Q9CXP9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Exo5Q9CXP9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms