Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tmed5Q9CXE7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmed5Q9CXE7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmed5Q9CXE7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmed5Q9CXE7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed5Q9CXE7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tmed5Q9CXE7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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