Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prkrip1Q9CWV6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkrip1Q9CWV6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms