Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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